Depuis le lancement du projet (le 4 mai 2009) et jusqu'au 18 juin, 137.652.178.995 configurations spatiales ont été calculées. En un mois, les bénévoles ont déjà abattu une quantité de travail 13 fois plus importante qu'au cours de l'ensemble de la première phase du projet (6 mois de calcul, entre le 20 décembre 2006 et 20 juin 2007). La première phase de calcul s'était concentrée sur 168 protéines.

Ces bons résultats s'expliquent par une puissance de calcul beaucoup plus importante que lors de la première phase du projet (les ordinateurs ont évolué et il y a plus de participants) et par le nouveau code de l'application qui est beaucoup plus performant qu'auparavant.

Le 18 juin, les scientifiques du projet ont reçu une partie des résultats pour les groupes d'unités "0001" et "0002". Ces résultats réprésentent 0,09% de toutes les configurations spatiales qu'il faudra calculer sur le  projet (les 2.466.753 paires de protéines sont réparties en 2.467 groupes, chaque groupe contient 1.000 paires). Les scientifiques ont reçu les résultats de 275.335 unités de calcul. 120.144.832 configurations spatiales sur un total de 137.652.178.995, soit 0,09 % du travail.