Analyse de cristaux dans l'aide à la lutte contre le cancer
- Détails
- Écrit par : AF
- Catégorie parente: Actualités
Par l'équipe du projet Help conquer Cancer
Récapitulatif
En coulisses, les travaux se poursuivent au sein du projet Help conquer Cancer. L'équipe analyse actuellement des millions d'images de cristallisation traitées par les bénévoles de WCG, avec l'espoir de trouver des modèles qui aideront les chercheurs à construire de meilleurs outils de dépistage du cancer.
Chers volontaires de WCG:
Nous continuons d'analyser des millions d'images de cristallisation de la protéine que vous avez traité dans le cadre du projet Help Conquer Cancer, avec comme objectif final d'obtenir un aperçu du processus de cristallisation. À son tour, cela nous permettra de cristalliser le cancer et d'autres protéines liées à la maladie, de déterminer leurs structures, leurs fonctions, et concevoir des médicaments en conséquence. Nous visons l'identification de configurations non triviales, intéressantes et utiles en fin de compte dans ce grand et précieux jeu de données.
Nous nous efforçons d'intégrer des données plus détaillées, que nous avons reçu du Hauptman Woodward Institut et qui nous permettront d'interpréter les modèles que nous avons identifiés et ainsi, de les ajouter aux propriétés des protéines, aux conditions et aux données temporelles d'images spécifiques qui ont été traitées de World Community Grid.
Le travail se poursuit, quoique plus lentement à présent, comme le stagiaire postdoctorant travaillant sur l'intégration et l'exploration de données ait pris un congé pour élargir ses compétences en enseignement. Christian continue de consacrer un peu de son temps au projet HCC, mais il doit également approfondir l'analyse et rationaliser l'infrastructure nécessaire pour soutenir notre projet de cartographie des marqueurs du Cancer. (Mapping Cancer Markers)
Nous avons travaillé de nouveaux angles d'analyse avec un visiteur étudiant du Danemark, et un nouvel étudiant devrait commencer à travailler sur le projet à l'automne 2015.
texte original et données de publications: WCG infos HCC
Petit rappel sur la cristallisation des protéines: memoireonline
- Affichages : 2477
Des nouvelles de Mapping Cancer Markers (WCG)
- Détails
- Écrit par : AF
- Catégorie parente: Actualités
Récapitulatif
Bien que les travaux continuent, suffisamment de données ont déjà été traitées, pour permettre, à l'équipe de cartographie des marqueurs du Cancer, de commencer à identifier les signatures de scores élevés en les associant à des biomarqueurs du cancer des poumons en particulier. Le but ultime est de trouver des signatures qui permettent de distinguer plusieurs types de cancer, donnant aux physiciens et chercheurs un autre outil pour améliorer la détection, des résultats de traitements aux patients.
Une nouvelle étape franchie dans la découverte de bio-marqueurs à propos du cancer des poumons (MCM).
Après une longue période d'analyses exploratrices, Mapping Cancer Markers commence une phase nouvelle, plus ciblée d'analyse du cancer du poumon en avril 2015. Les résultats de la première étape de traitement, ont révélé un sous-ensemble d'environ 1 % des biomarqueurs qui se produisent fréquemment dans les signatures de scores élevés. La seconde étape des études sur le cancer des poumons par MCM se focalisera sur ces signatures remarquables de ce sous-ensemble de biomarqueurs.
Parmi les premières questions de recherches, nous visons comme objectif de répondre, dans la seconde phase, à celles de la nature des signatures réussies et de l'espace de signature réduite.
Le sous-ensemble de biomarqueurs dans le stade ciblé arrivera-t-il mieux à distinguer le cancer du poumon dans les échantillons de tissus?
L'effet de la longueur de la signature (nombre de biomarqueurs) sur la performance de signature que nous avons remarqué dans la phase exploratoire apparaîtra-t-elle également dans cet espace réduit de signature?
Quels sont les modèles de biomarqueurs les plus performants qui ressortent dans les signatures du cancer ?
La plupart des fonctions biologiques sont atteintes par plusieurs gènes (ou protéines) participant à un réseau coordonné ou signalisation cascade (chemin d'accès), donc découvrirons-nous des paires ou des plus grands groupes de biomarqueurs qui cohabitent régulièrement dans les signatures réussies?
Ces groupes de biomarqueurs correspondront-ils aux réseaux biologiques connus, ou est-ce que ces signatures réussies tirent-elles nécessairement leurs membres d'un réseau multiple?
Suffisamment de résultats lors de la seconde étape nous ont été renvoyés afin de commencer l'étude préliminaire. L'un des premiers objectifs de cette seconde phase est de découvrir des signatures cancéreuses plus performantes. Nous avons utilisé les résultats de la première étape afin de réduire le champ potentiel des bio-marqueurs qui étaient de plus de 22'00 à un sous-ensemble de 223.
- Affichages : 3553
Lire la suite : Des nouvelles de Mapping Cancer Markers (WCG)
Cosmology@home : news Juillet 2015
- Détails
- Écrit par : JeromeC pour la traduction et Polynésia pour le mise sur le portail
- Catégorie parente: Actualités
Traduction de cet article.
13 juillet 2015
Peut-être allons-nous commencer par ce qu'est Cosmology@Home
Cosmology@Home (C@H pour faire court) est un projet bénévole de calcul distribué qui permet aux gens du monde entier à faire don de leur temps processeur non utilisé (par exemple lorsque l'économiseur d'écran est activé) pour aider les cosmologistes à exécuter les calculs dont ils ont besoin pour répondre à certaines des plus grandes questions au sujet de notre univers.
Beaucoup d'entre qui lisez ceci sont peut-être déjà des bénévoles, dans ce cas, bonjour et merci!
Si vous ne l'êtes pas, mais que vous l'aimiez bien l'être, voici comment.
- Affichages : 3073
Résultats pour Computing for Clean Water (WCG)
- Détails
- Écrit par : AF
- Catégorie parente: Actualités
traduction faite par JérômeC
L'équipe de Computing for Clean Water a découvert comment l'eau peut passer à travers de minuscules nanotubes de carbone beaucoup plus facilement que ce qui avait été prévu jusqu'à présent. Cette compréhension révolutionnaire d'un processus physique fondamental ouvre un potentiel pour améliorer l'accès à l'eau potable pour des millions de personnes grâce à une filtration plus efficace de l'eau, le dessalement ainsi que des applications possibles dans les énergies propres et la médecine. Cette découverte a été publiée dans Nature Nanotechnology, la plus prestigieuse revue de la nanotechnologie dans le monde.
------------------------------------------------------------------------------------------------------
Notre équipe a découvert un phénomène qui constitue une étape importante sur la voie de rendre disponible de l'eau propre pour tous ceux qui en ont le plus besoin. L'eau propre est fondamentale à la vie, et pourtant près d'un milliard de personnes dans le monde n'y ont pas accès. Ce n'est pas juste une question de confort : plus d'un million de personnes meurent chaque année de maladies causées par l'eau insalubre. Avec la croissance démographique et le changement climatique, le problème devrait empirer. Les technologies existantes de filtrage de l'eau sont souvent coûteuses, et les gens qui en ont le plus besoin sont les moins en mesure de les payer. Les recherches de Computing for Clean Water que vous avez permises avec votre puissance de calcul peuvent aider à changer le statu quo. Ces résultats passionnants viennent d'être publiés dans la revue Nature Nanotechnology, la plus prestigieuse revue de la nanotechnologie dans le monde.
- Affichages : 2912
Lire la suite : Résultats pour Computing for Clean Water (WCG)
WCG Une étape et une feuille de route : progrès dans la lutte contre Ebola
- Détails
- Écrit par : AF
- Catégorie parente: Foire Aux Questions
traduction Oncle Bob ░░░ Outsmart Ebola Together, un projet scientifique à long terme dont le but est de trouver de nouveaux médicaments pour guérir Ebola et les fièvres hémorragiques mortelles apparentées, en est toujours à ses débuts, mais nous avons déjà atteint une étape majeure. Notre première cible fut le site de liaison du récepteur de la protéine de surface d'Ebola, GP, découvert récemment. GP est la molécule du virus Ebola qui est utilisée pour se fondre avec la paroi d'une cellule humaine et s'introduire en elle. Armés d'un nouveau modèle de site de liaison, et avec les vastes ressources de WCG, nous avons testé ce site avec des médicaments qui pourraient potentiellement se lier avec lui, et, grâce à cela, empêcher l'infection par Ebola. Cette étape de l'étude est maintenant pratiquement terminée : nous avons reçu de WCG la plupart des données envoyées : 5,4 million de composants chimiques candidats.
Lire la suite : WCG Une étape et une feuille de route : progrès dans la lutte contre Ebola
Résumé : Grâce à l'énorme aide apportée par World Community Grid, l'équipe de l’Institut de Recherches Scripps a déjà reçu la plupart des données pour la première protéine cible du virus Ebola. Pendant que ces données sont analysées, la recherche se dirige maintenant vers une autre protéine apparentée ayant un potentiel pour aider à combattre les fièvres hémorragiques.
Résultat concret du Projet WCG "Say No To Schistosoma
- Détails
- Écrit par : AF
- Catégorie parente: Les Projets BOINC
L'équipe de recherche a analysé scrupuleusement les résultats des calculs du projet: "Dites NON à la Schistosomiase".
Petit rappel de la maladie:
source OMS
"La schistosomiase (ou bilharziose) est une maladie chronique provoquée par des vers parasites.
Au moins 243 millions de personnes ont besoin d’un traitement contre la schistosomiase en 2011.
28,1 millions de personnes atteintes ont été traitées pour la schistosomiase en 2011.
Le risque d’infection est lié à l’exposition à des eaux infestées lors d’activités agricoles, domestiques ou de loisirs.
Le manque d’hygiène et les jeux rendent les enfants particulièrement vulnérables."
A l'aide de plusieurs techniques d'analyse complémentaires, afin d'aider les chercheurs à sélectionner des composés prometteurs, trois substances intéressantes font l'objet de tests supplémentaires avec l'espoir d'identifier des traitements potentiellement plus efficaces contre la schistosomiase.
Grâce aux bénévoles du World Community Grid qui ont contribué au projet, nous avons sélectionné des composés de la projection basée sur les grilles de calcul pour des tests supplémentaires. Nous avons collaboré avec différents laboratoires pour lancer d'autres analyses par ordinateur de 24 composés à l'aide de plusieurs outils logiciels.
Ces outils aident en fournissant des informations sur les nombreuses caractéristiques des composés tels que la toxicologie, l'absorption, les interactions, la pharmacocinétique et plus encore.
Les modèles QSAR ont été utilisés pour continuer à évaluer les résultats.
Pour plus d'infos sur QSAR, voir ici en anglais et ici en français.
De l'analyse des calculs, trois composés ont été identifiés comme les meilleures substances. Pour les prochaines étapes, nous poursuivons les tests in vitro de ces composés pour déterminer s'ils pourraient être des options viables pour le traitement de la schistosomiase.
Nous tenons à remercier et à souligner l'aide de bénévoles du World Community Grid et d'IBM qui ont rendu ce projet possible.
Nous sommes sûrs que nous pourrons continuer nos efforts pour trouver de nouveaux traitements contre la schistosomiase.
- Affichages : 2818
Page 31 sur 35