Par: Dr. Carlos López Muskus
Coordinateur, biologie moléculaire et informatique Unité, Université PECET d'Antioquia
8 septembre 2016
Récapitulatif
L'équipe de "Drug Search for Leishmaniasis" a récemment publié ses résultats dans le "Journal of Computer-Aided Molecular Design". En utilisant la puissance de calcul du World Community Grid, ils ont identifié plusieurs composés médicamenteux qui peuvent conduire à l'amélioration des traitements pour cette maladie négligée et parfois mortelle.
L'un des meilleurs ligands liés à la déshydrogénase dihydrorootate (DHODH) de la Leishmania major.
(a) la liaison prédite à l'intérieur de la structure cristalline
(b) Superposition des conformations du ligand prédit se lier à chacune des conformations de protéines extraites à partir DHODH la simulation MD
Contexte
La Leishmaniose, l'une des maladies tropicales les plus négligées dans le monde, infecte plus de deux millions de personnes chaque année. La maladie est provoquée par un parasite (genre Leishmania) qui est transmis entre les humains et les animaux femelles par phlébotomes. Le nombre de cas continue d'augmenter dans les pays tropicaux tels que le Bangladesh, l'Inde, le Soudan, l'Ethiopie, le Brésil, la Colombie, le Pérou et d'autres.
Les traitements existants pour la leishmaniose peut provoquer des effets secondaires graves. En outre, les parasites résistants aux médicaments sont à l'origine des problèmes majeurs dans de nombreux pays. Pour ces raisons, il y a un un besoin urgent de nouveaux composés médicamenteux anti-leishmaniose, sûrs et peu coûteux.
Aperçu
Dans notre article, nous décrivons en détail les étapes que nous avons prises pour identifier les cibles de médicaments protéiques, qui comprenait la projection de 600.000 molécules afin de déterminer ce qui pourrait conduire au développement de nouveaux traitements pour la maladie. Plus précisément, nous avons cherché des médicaments qui ciblent les protéines qui sont essentielles à la survie du parasite qui provoque la leishmaniose. En trouvant des molécules qui se lient à ces protéines, ils peuvent potentiellement être désactivées, arrêtant ainsi l'infection et permettant de guérir la maladie.
Le document décrit la façon dont certaines des cibles de protéines peuvent se plier et changer de forme, ce qui présente des difficultés à trouver de bonnes molécules candidates. Nous discutons de notre approche pour faire face à ces problèmes.
En utilisant les résultats calculés sur le World Community Grid, nous avons sélectionné les dix meilleurs candidats de médicaments pour les expériences de laboratoire, ce qui a donné des résultats très prometteurs. En particulier, l'un des composés semble être capable de tuer le parasite de la leishmaniose, sans affecter les cellules humaines in vitro. Trois autres composés ont également montré des résultats prometteurs.
Nous prévoyons maintenant de travailler à modifier les trois composés prometteurs médicamenteux identifiés pour améliorer leur efficacité, la solubilité et pour minimiser la toxicité. Nous allons également évaluer d'autres meilleurs candidats en fonction des fonds que nous pouvons soulever. En outre, nous développons une plate-forme de données ouvertes avec des résultats World Community Grid's afin que d'autres chercheurs puissent exploiter nos données pour détecter des cibles de médicaments supplémentaires ou des prospects.
Vous pouvez lire un résumé de l'article ici. Nous sommes reconnaissants à tous les bénévoles du World Community Grid qui ont rendu cette recherche possible en faisant don de leur puissance de calcul à ce projet.
Les chercheurs publient des résultats sur le potentiel de nouveaux traitements pour la leishmaniose
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