Récapitulatif
Comme nous l'avons annoncé le mois dernier, le temps du Microbiome Immunity Project sur le World Community Grid se termine, mais l'analyse des données bat son plein. Ce sera la dernière mise à jour mensuelle de ce projet.
Contexte
Des milliards de bactéries vivent à l'intérieur et sur notre corps. Le projet Microbiome Immunity Project utilise la puissance de calcul du World Community Grid pour étudier les protéines produites par ces bactéries, qui sont codées dans leurs génomes. Cela peut aider les scientifiques à comprendre le rôle du microbiote dans la maladie.
Articles en cours
Les chercheurs prévoient deux articles qui utiliseront les données du World Community Grid. (Leur premier article, qui faisait référence aux techniques qu'ils ont développées à la suite du projet, a été publié fin mai.) Ce mois-ci, ils se concentrent sur une analyse plus approfondie et la rédaction de l'un des articles, qui, selon eux, intéressera largement d'autres scientifiques travaillant sur le microbiote et dans des domaines connexes.
Plans à venir
Comme nous l'avons annoncé dans la mise à jour du mois dernier, le temps du projet sur World Community Grid se terminera dès que les unités de travail actuelles seront terminées. Vous pouvez lire un article publié par l'un des chercheurs sur le forum Microbiome Immunity Project (voir encadré) avec plus d'informations.
Il s'agira de la dernière mise à jour mensuelle du projet, mais nous resterons en contact avec l'équipe de recherche au cours des prochains mois au fur et à mesure que l'analyse des données progresse. Pour commencer, les chercheurs préparent une mise à jour du projet, que nous prévoyons de publier dès qu'elle sera terminée. Nous ferons également des annonces au fur et à mesure que leurs articles seront publiés ou s'ils ont d'autres nouvelles.
Statut actuel des unités de travail
Nous nous attendons à ce que l'offre actuelle d'unités de travail soit envoyée aux bénévoles d'ici le 17 juillet, à quelques jours près. Après cela, il y aura environ deux semaines de travail en cours (y compris les éventuels renvois). Nous prévoyons que toutes les unités de travail seront complètement traitées d'ici la fin juillet.
13 juil. 2021
Forum :
Sujet : Annonce importante sur l'avenir du Microbiome Immunity Project
Chers bénévoles du World Community Grid,
Merci pour vos contributions héroïques au Microbiome Immunity Project ! Vos efforts nous ont permis de prédire les structures de plus de 330 000 protéines contenues dans le microbiome, améliorant considérablement notre compréhension des fonctions contenues dans cette communauté incroyablement complexe qui habite tout notre corps et sous-tend de nombreux aspects de notre santé et de nos maladies.
Avec l'avènement récent de nouvelles techniques de repliement des protéines basées sur l'IA et l'apprentissage en profondeur, il est désormais possible de calculer ces structures des centaines de fois plus rapidement qu'au début du projet. Nous terminons donc le projet à la fin du mois de juin, en associant les résultats à de nouvelles techniques plus rapides qui peuvent être exécutées sur des clusters de calcul hautes performances traditionnels et n'ont pas besoin de la puissance du World Community Grid.
Cela signifie que votre effort bénévole a transformé l'accessibilité de la biologie structurelle pour les chercheurs en microbiome du monde entier, permettant à ces techniques d'être incorporées dans des milliers de projets sur le microbiome, ciblant des maladies allant du diabète de type 1 et des maladies inflammatoires de l'intestin au cancer et aux maladies neurologiques. , et menée dans le monde entier.
Nous avons déjà publié un article scientifique résultant des techniques développées à partir de ce projet, avec un deuxième en cours qui appliquera ces protocoles aux résultats que vous avez générés. Nous vous tiendrons au courant des autres découvertes au fur et à mesure que nous les publierons.
Merci encore pour vos contributions impressionnantes au MIP !
En vous souhaitant le meilleur,
,
L'équipe du projet Microbiome Immunity
traduction de l'article WCG : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=716