Une nouvelle application HMMPfam vient d'être distribuée pour les machines sous Linux et MacOS X (Intel et PowerPC). Elle permet des calculs environ trois fois plus rapides que l'ancienne version. Cette optimisation devrait bientôt être disponible sous Windows. L'amélioration a pu être mise en place grâce à Thomas Rattei du projet Simap, qui a partagé le code source de sa propre application hmmpfam.
Lattice Project : optimisation de l'application HMMPfam
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- Écrit par : Heyoka
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