20 Septembre 2006

Traduction du journal du Dr David Baker sur le forum de Rosetta@Home

Les premières unités de travail pour la conception de vaccins viennent juste d'être envoyées sur rosetta@home ! En ce qui concerne la conception de vaccins, nous adoptons un certain nombre d'approches différentes ; pour les calculs qui viennent juste d'être envoyés, nous essayons de stabiliser la protéine GP120 qui enveloppe le VIH et change de conformation lorsqu'elle interagit avec d'autres protéines , si nous y arrivons ceci pourrait être employé comme vaccin. Nous gardons tel quel la partie de la protéine qui interagit avec un récepteur de surface cellulaire appelée CD4, mais nous remodelons le reste pour augmenter leur stabilité. Les modélisations ayant la plus basse énergie parmis toutes les unités retournées seront analysées ici, et les plus prometteuses seront envoyés à nos collaborateurs au NIH pour les examiner en tant que possibles vaccins.

Cette première série d'unités de travail est relativement petite -- unités de travail commençant par « PSH » ; la semaine prochaine, nous enverrons un groupe beaucoup plus grand et nous leur donnerons des noms plus instructifs ainsi vous pouvez mieux visualiser ce que vous calculez

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