L'application actuelle est issus d'une toute nouvelle méthodologie crée par Phil Bradley. Elle consiste à modéliser les fibrilles amyloïdes qui sont la cause de nombreuses maladies humaines. A partir de cette semaine, le projet se penche sur la modélisation des fibrilles amyloïdes qui se forment lors de la maladie d'Alzheimer. Non seulement ces calculs seront important dans une perspective de santé humaine, mais c'est également un défi intéressant pour la prévision de structures. En effet la longueur de la protéine qui forme les fibrilles liées à la maladie est de seulement 41 acides aminés. Mais au lieu de se plier en une structure simple indépendante , elle s'associe à beaucoup d'autres copies d'elle-même pour former des fibrilles hélicoïdales prolongées.
Phil a mis en place une application qui permet un traitement global de la symétrie permettant de modéliser le repliement et l'association simultanée de plusieurs copies de la protéine à 41 résidus -- comme toutes les copies ont des marqueurs identiques il est possible de modeler ces nombreuses de copies sans augmenter de manière significative la taille de l'espace de recherche.
Capture d'écran de l'écran de veille