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Catégorie parente: Actualités

 

L'équipe de l'ARP se prépare à redémarrer le projet qui a été mis en pause en décembre 2022. Cet article décrit les étapes que nous suivons pour redémarrer ce projet.

Projet : Africa Rainfall Project

Publié le : 25 avr. 2024

Contexte

Le projet Africa Rainfall Project (ARP) vise à simuler les tempêtes de pluie en Afrique subsaharienne afin d'améliorer les prévisions météorologiques régionales. L'objectif est de réaliser une simulation météorologique à haute résolution (1 km) pour l'ensemble de la région sur une période d'un an. La fourniture de prévisions météorologiques précises est cruciale pour l'autosuffisance de la communauté agricole locale. En comparant les résultats obtenus par le calcul de données pluviométriques provenant de diverses sources à l'aide du World Community Grid, les scientifiques peuvent créer des prévisions de plus en plus précises, améliorer les simulations futures et, à leur tour, les prévisions météorologiques. Pour en savoir plus sur ce projet, consultez notre mise à jour de mars 2022.

En décembre 2022, le projet a été mis en pause en raison des limites de capacité de leur système de stockage. Pour en savoir plus sur les détails de cette limitation de stockage, veuillez consulter la mise à jour de l'ARP de mars 2023. Comme nous l'avons indiqué dans une mise à jour de juillet 2023, une partie de ce défi était liée au fait que le soutien au stockage de l'équipe ARP par SURF, l'association coopérative des établissements d'enseignement et de recherche néerlandais, était arrivé à son terme. Heureusement, Amazon Web Services (AWS) a accepté d'héberger les données, et c'est ainsi qu'a commencé le processus de transfert des données. Depuis que le transfert est terminé, l'équipe de l'ARP a pris des mesures pour rendre les données plus largement accessibles via la plateforme AWS, mais ce travail n'en est qu'à ses débuts. Actuellement, l'accent est mis sur la finalisation de la préparation des nouvelles unités de travail et sur la production des données nécessaires

Mise à jour sur le redémarrage de l'ARP

Nous avons commencé à travailler sur la reprise de l'envoi des unités de travail ARP1 aux volontaires. Nos partenaires de recherche à TU Delft nous ont déjà envoyé la plupart des scripts et de la documentation nécessaires, que nous avons examinés et mis en œuvre localement. Nous attendons actuellement de savoir si nous recevrons directement le reste des données et du code d'application nécessaires, ou si nous devrons reproduire ces composants à partir de la documentation fournie par l'équipe de la TU Delft. Nous avons estimé que les deux approches sont réalisables et nous voulions informer les volontaires que nous sommes sur la bonne voie pour redémarrer ARP1 dans les semaines à venir.

 

Le calendrier d'un éventuel redémarrage de ce projet dépend des informations fournies par l'équipe ARP. Si le code et les données nécessaires ne sont pas entièrement disponibles, nous devrons construire les composants manquants du pipeline pour générer de nouveaux travaux ARP1 et confirmer que nous sommes en mesure de reproduire les mêmes entrées que celles que nous avons précédemment reçues des serveurs de TU Delft pour valider le nouveau pipeline. Quoi qu'il en soit, il n'y aura aucun changement et aucune action ne sera requise de la part des volontaires pour faciliter le processus et, lorsque ARP1 redémarrera, la distribution des unités de travail sera la même qu'auparavant.

Figure 1. Un exemple d'unité. Chaque unité comprend trois domaines imbriqués (à sens unique) avec une résolution respective de 9 km, 3 km et 1 km.

Merci à l'équipe de l'ARP pour son partenariat continu avec le WCG. Si vous avez des questions ou des commentaires, n'hésitez pas à les laisser dans ce fil de discussion pour que nous puissions y répondre.

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BOINC est finaliste pour un prix important et a besoin de votre vote (*avant dimanche) :

Contexte : Le Sommet mondial sur la société de l'information (WSIS) est une initiative parrainée par les Nations unies visant à exploiter le potentiel des technologies de l'information et de la communication pour construire des sociétés de l'information inclusives et équitables dans le monde entier. BOINC a été nominé pour un prix au forum 2024 et a passé les premiers obstacles ; la prochaine et dernière étape ("Phase 3") requiert des votes publics. Le prix serait un très bon coup de pouce et une validation pour BOINC et tous nos projets ; si nous parvenons à faire voter nos communautés, nous devrions avoir une bonne chance à ce stade...

Le vote est très simple, il ne prend que quelques minutes ; les instructions sont ici. [in English]

(*La date limite pour les votes est dimanche : 31 mars 2024, 23:00 UTC+02:00)

 

Source : https://lhcathome.cern.ch/lhcathome/forum_thread.php?id=6129&postid=49840#49840

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Nous sommes heureux d'annoncer un concours encourageant les lycéens à s'initier à la science des données et au calcul distribué en utilisant BOINC et World Community Grid.

Comme nous l'avons souligné dans notre lettre d'information d'octobre 2023, nous avons travaillé à l'établissement d'un lien plus fort avec les écoles secondaires. Nous sommes heureux d'annoncer un concours encourageant les lycéens à apprendre la science des données et le calcul distribué en utilisant BOINC et World Community Grid.

Le concours, Computation Moonshot, vise à ce que les étudiants contribuent à des résultats réels et utiles pour les chercheurs dans une atmosphère de compétition passionnante. Le concours est organisé par The Science Commons Initiative et se déroulera du 25 mars au 7 mai 2024. Bien que le concours principal soit ouvert à toutes les écoles secondaires des États-Unis et à leurs élèves, nous espérons qu'il suscitera un intérêt mondial. Des prix seront décernés à l'école ayant le plus grand nombre de contributeurs actifs, à l'école ayant contribué au plus grand nombre d'heures de traitement et à l'école ayant le plus grand nombre de contributeurs actifs par rapport au nombre d'élèves. Les prix vont de l'équipement scientifique aux cartes-cadeaux en passant par les bourses d'études.

Ce concours n'est pas le premier concours de calcul en grille organisé sur le WCG. En 2019, la Stockholm Science and Innovation School en Suède a organisé une compétition entre 5 équipes, contribuant à plus de 25 années CPU et 45 945 résultats en un mois pour les projets MCM et MIP. Une autre de nos écoles secondaires partenaires, la Sisler High School au Canada, a participé à Compute for the Cure 2021, un concours de dons MCM de deux semaines, renvoyant 52 392 résultats et obtenant la deuxième place du concours. L'école a également organisé ses propres concours au sein de l'établissement. Les deux écoles secondaires ont fait remarquer que les concours constituaient une occasion d'apprentissage précieuse pour les élèves et un moyen passionnant de les motiver à l'égard de l'informatique distribuée. Le groupe croissant de nos partenaires lycéens comprend la Boca Raton Community High School, qui a créé un club WCG et élargit le programme des sciences en apprenant les projets WCG, la programmation et le calcul à haute performance.

Nous attendons avec impatience le concours Computation Moonshot et les possibilités qu'il offrira d'enrichir l'apprentissage des élèves. L'inscription à ce concours est désormais ouverte. Pour plus d'informations sur le concours et les modalités d'inscription, veuillez consulter le site web Computation Moonshot.

 

Publié le : 22 févr. 2024

Source : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=808

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Chers tous, nous avons obtenu des résultats pour différentes cibles du SARS-CoV-2. Les calculs se poursuivent et nous souhaitons vous demander votre avis sur la prochaine cible. Vous pouvez voter pour l'une d'entre elles jusqu'au 5 février 2024.

Études complémentaires sur la protéase principale du SRAS-CoV-2 (3CLpro)

Il s'agit d'une cible thérapeutique cruciale contre le SRAS-CoV-2. La 3CLpro (protéase à cystéine ; EC 3.4.22.69) en particulier est cruciale pour le clivage des polyprotéines du coronavirus afin de former des protéines non structurelles matures qui sont elles-mêmes essentielles pour les mécanismes de réplication virale. Nous avons encore besoin de beaucoup de recherches sur cette cible pour mettre au point de nouveaux inhibiteurs plus puissants.

Glycoprotéine (GP) du virus Ebolavirus

Le virus Ebola est un agent pathogène dangereux pour l'homme et cette cible pourrait être un cas d'étude parfait pour un scénario de conception de médicaments de type PPI. La glycoprotéine (GP) de l'EBOV est la seule protéine exprimée à la surface du virion et est essentielle pour l'attachement aux cellules hôtes et la catalyse de la fusion membranaire.

Coronavirus du syndrome de diarrhée aiguë du porc (SADS-CoV PLpro)

Cette cible nous permettrait d'étudier la conception de plusieurs cibles virales apparentées. Le coronavirus du syndrome de la diarrhée aiguë chez le porc (SADS-CoV), un coronavirus entérique récemment apparu, est considéré comme associé au syndrome de la diarrhée aiguë chez le porc (SADS), qui a entraîné des pertes économiques considérables pour l'industrie porcine. L'agent pathogène présente un potentiel de saut d'hôte.

 

Source : https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=268#2176

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BOINC Census 2023

Welcome to the BOINC Census for 2023!

L'enquête BOINC 2023 menée par thesciencecommons.org ça se trouve ici.

 5-10mn max pour le remplir et des résultats fort intéressants pour la communauté.

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Applications sporadiques

BOINC a été conçu à l'origine comme un système de traitement par lots : vous soumettez des tâches, elles s'exécutent (indépendamment les unes des autres) et finissent par se terminer. Mais certaines utilisations potentielles de l'informatique distribuée ne correspondent pas à ce modèle. Elles peuvent nécessiter que les applications s'exécutent simultanément sur différents ordinateurs, et éventuellement qu'elles communiquent directement les unes avec les autres. Il s'agit par exemple du calcul parallèle de type MPI et de l'apprentissage automatique distribué. Le mécanisme d' "application sporadique" de BOINC est conçu pour prendre en charge ces types de systèmes et leur permettre de coexister avec le traitement par lots.

Dans ce schéma, il existe un système distribué - appelons-le "système invité" - qui existe en dehors de BOINC. Le système invité possède généralement son propre serveur qui traite les demandes et les transmet aux "nœuds de travail" qui exécutent le client BOINC. La partie "serveur" du système invité fonctionne comme une application sporadique sur ces nœuds. Les instances peuvent communiquer directement entre elles - de pair à pair ou par l'intermédiaire d'un relais - ainsi qu'avec le serveur.

Le système invité utilise BOINC pour

  • Distribuer et exécuter en toute sécurité son code de travail (l'application sporadique).
  • Appliquer les préférences informatiques des volontaires (quand calculer, combien d'unités centrales utiliser, etc.)
  • Pour les volontaires qui utilisent déjà BOINC, répartir la puissance de calcul entre les projets.


Le système invité n'utilise pas les fonctions de traitement par lots de BOINC.

Les tâches d'une application sporadique s'exécutent (c'est-à-dire qu'elles sont présentes en mémoire) en permanence, comme les tâches non gourmandes en CPU (nci), mais elles ne calculent qu'une partie du temps. Comme les applications classiques, une application sporadique peut avoir plusieurs versions. Chacune d'entre elles possède une classe de plan, qui détermine l'utilisation du processeur (CPU et GPU) de ses tâches. Le planificateur BOINC d'un projet peut envoyer plusieurs tâches pour une application sporadique donnée, en utilisant la même version d'application ou des versions différentes.

Un projet BOINC peut fournir n'importe quelle combinaison d'applications régulières, sporadiques et non gourmandes en CPU (nci). Un client peut être connecté à plusieurs projets avec des applications sporadiques.

Comme les tâches régulières, une tâche sporadique ne peut calculer que lorsque BOINC l'autorise, c'est-à-dire :

  • le calcul (et le calcul GPU le cas échéant) est activé par les préférences de l'utilisateur
  • il y a suffisamment de ressources de traitement et de RAM


En outre, un travail sporadique ne peut calculer que lorsque le système invité le lui demande. Ainsi, un travail sporadique converse à la fois avec le client BOINC et avec le serveur du système invité ; il ne calcule que lorsque le serveur le lui demande et lorsque le client dit qu'il peut le faire.

 

(la suite ci-dessous)

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Lire la suite : BOINC : Applications sporadiques

  1. WCG NEWSLETTER Numéro 3 octobre 2023
  2. WCG : 'équipe MCM a effectué des recherches sur le GSDMB
  3. RÉSULTATS DE LA RECHERCHE PROFONDE DANS TOUT LE CIEL SUR LES DONNÉES DE LIGO O3
  4. Le point sur les recherches de l'équipe MCM (mars 2023)
  5. Le projet SCC entame une nouvelle phase dans sa quête de guérison des cancers infantiles
  6. WCG Mise à jour de la recherche par l'équipe ARP (mars 2023)

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