WCG : L'équipe MCM a effectué des recherches sur le GSDMB
Nous poursuivons notre travail de caractérisation des biomarqueurs du cancer du poumon identifiés dans le cadre du projet MCM1. Cette mise à jour se concentre sur GSDMB, un gène associé à la survie du cancer du poumon et exprimé de manière différentielle dans plusieurs types de cancer par rapport aux tissus normaux.
Projet : Cartographie des marqueurs du cancer
Publié le : 12 juil. 2023
Contexte
Reconnaître des schémas chez les patients atteints de cancer peut présenter de nombreux avantages, notamment permettre de détecter des signes de cancer chez d'autres patients et personnaliser le traitement de chaque patient en fonction de son profil cancéreux spécifique. Depuis novembre 2013, les volontaires de la World Community Grid ont donné plus de 820 800 années CPU au projet, aidant à analyser les données de recherche sur les cancers et les sarcomes à une vitesse que l'on n'aurait jamais cru possible auparavant. Nous sommes immensément reconnaissants envers les volontaires qui continuent à faire des dons à ce projet et qui nous aident à accélérer la recherche de meilleurs biomarqueurs.
Nous poursuivons notre analyse des biomarqueurs les plus courants chez les patients atteints de cancer du poumon. Après les discussions sur les gènes VAMP1 et FARP1 décrites dans nos mises à jour de mars et d'avril, nous nous concentrons ici sur le GSDMB.
Recherche sur la GSDMB
La gasdermine B (GSDMB) est une protéine de la famille des GSDM, qui partagent des structures similaires et jouent généralement un rôle dans la prolifération et la différenciation cellulaires[1]. La famille GSDM est connue pour son rôle dans le déclenchement de la pyroptose, un type de mort cellulaire hautement inflammatoire, qu'elle accomplit en formant des pores dans les membranes cellulaires[1]. GSDMB a également été identifié pour réguler la croissance des cellules épithéliales indépendamment de son rôle dans la pyroptose (Uniprot). La GSDMB est considérée comme unique parmi les autres membres de sa famille, et son rôle dans divers types de maladies et de cancers est relativement peu étudié. Il a été démontré que les variantes génétiques de GSDMB sont liées à une susceptibilité accrue à des maladies telles que l'asthme et les maladies inflammatoires de l'intestin (MICI)[2].
De même que pour les gènes VAMP1 et FARP1, nous avons étudié le rôle de GSDMB dans le cancer du poumon et nous avons constaté que sa présence avait un rôle protecteur dans le cancer du poumon, comme le montre la figure 1 (données de KMplotter).
Figure 1. Courbes de survie des patients présentant une forte et une faible expression de GSDMB.
En étendant notre observation au-delà du cancer du poumon, comme c'est l'un des objectifs de notre projet WCG, nous constatons que GSDMB se comporte de manière similaire dans la majorité des cancers testés, comme le montre la figure 2. Cela suggère que GSDMB a un rôle important dans la carcinogenèse et peut jouer un rôle dans les caractéristiques du cancer. Cela a été confirmé dans la littérature, où une association a été trouvée entre les niveaux d'expression de GSDMB et des cancers tels que le cancer gastrique, le cancer du sein[3] et le cancer de la vessie[4].
Figure 2. Expression de GSDMB dans les tissus normaux et cancéreux pour plusieurs types de cancer.
En utilisant le Human Protein Atlas (HPA), nous avons également identifié une forte valeur pronostique de la protéine GSDMB, comme le montre la figure 3.
Figure 3. Valeur pronostique de la protéine GSDMB dans les cancers du rein (défavorable), de l'urothélium et du col de l'utérus (favorable).
En explorant l'expression de la protéine GSDMB à l'aide du portail GTEx (GTEx), nous identifions les cellules du poumon qui l'expriment, comme le montre la figure 4.
Figure 4. Les données sur les cellules individuelles du portail GTEx montrent une forte expression dans les cellules épithéliales et immunitaires.
Si vous avez des commentaires ou des questions, n'hésitez pas à les laisser dans ce fil de discussion pour que nous puissions y répondre. Nous vous remercions pour votre soutien continu.
L'équipe du WCG
Références :
Li L, Li Y, Bai Y. Rôle du GSDMB dans la pyroptose et le cancer. Cancer Manag Res. 2020 Apr 30;12:3033-3043. doi : 10.2147/CMAR.S246948. PMID : 32431546 ; PMCID : PMC7201009.
Rana N, Privitera G, Kondolf HC, Bulek K, Lechuga S, De Salvo C, Corridoni D, Antanaviciute A, Maywald RL, Hurtado AM, Zhao J, Huang EH, Li X, Chan ER, Simmons A, Bamias G, Abbott DW, Heaney JD, Ivanov AI, Pizarro TT. GSDMB est augmenté dans les MICI et régule la restitution/réparation épithéliale indépendamment de la pyroptose. Cell. 2022 Jan 20;185(2):283-298.e17. doi : 10.1016/j.cell.2021.12.024. Epub 2022 Jan 11. PMID : 35021065 ; PMCID : PMC8879997.
Xia X, Wang X, Cheng Z, Qin W, Lei L, Jiang J, Hu J. The role of pyroptosis in cancer : Pro-cancer ou pro-"hôte" ? Cell Death & Disease. 2019;10(9). doi:10.1038/s41419-019-1883-8. PMID : 31501419 ; PMCID : PMC6733901.
He H, Yi L, Zhang B, Yan B, Xiao M, Ren J, Zi D, Zhu L, Zhong Z, Zhao X, Jin X, Xiong W. USP24-GSDMB complex promotes bladder cancer proliferation via activation of the STAT3 pathway. Int J Biol Sci. 2021 Jun 11;17(10):2417-2429. doi : 10.7150/ijbs.54442. PMID : 34326684 ; PMCID : PMC8315027.
Source : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=797