Site du projet : http://www.worldcommunitygrid.org/
Bienvenue sur le bulletin d'information d'Octobre du projet World Community Grid. Au cours des six derniers mois, la communauté WCG mondiale a accompli des avancées significatives. Trois projets ont été achevés, et deux nouveaux projets ont été lancés. Nous avons décidé de faire de BOINC (la plateforme pour le calcul en grilles volontaire et distribué), la plateforme unique de WCG, et sommes maintenant en cours de migration complète de l'infrastructure sur BOINC. Nous avons également ajouté un certain nombre de dispositifs intéressants au site Web. Cette information et bien d'autres vous sont présentés dans ce bulletin.
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Progression de la recherche
Depuis le lancement du projet WCG en novembre 2004, plus de
750.000 résultats ont été
validés. La puissance de calcul offerte par la communauté des volontaires représente l'équivalent
de 115.000
années de calcul pour un PC fonctionnant sans interruption. Actuellement, les volontaires mettent à disposition une moyenne de
1.100 années de calcul par semaine ! En
conséquence, WCG gère simultanément quatre projets
et en a déjà accompli
quatre. Plus de détails au sujet de chacun de ces projets sont
fournis ci-dessous.
Nos projets les plus récents - AfricanClimate@Home
et Ensemble,
découvrons un médicament contre la dengue - sont également décrits dans ce
bulletin d'information. En outre, en 2007, nous comptons lancer un
nouveau projet pour la lutte contre le Cancer et commencer à
travailler sur la deuxième phase du projet Ensemble,
découvrons un médicament contre la dengue.
2008 devrait voir apparaître un projet contre le Cancer, un
projet contre la Malaria, et la phase 2 du projet de Lutte Contre la Dystrophie Musculaire. Si vous connaissez une
organisation intéressée par une
recherche qui pourrait être effectuées sur WCG, indiquez leur, s'il vous
plait, la page pour la soumission d'une
proposition.
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AfricanClimate@Home
World Community Grid et le « Climate Systems Analysis Group » de l'Université de Cape Town lancent un vaste projet informatique qui permettra d'optimiser la modélisation régionale du climat. L'objectif est d'obtenir des prévisions affinées sur les effets du changement climatique en Afrique.
Si le changement climatique a un lourd impact sur nombre de domaines, les conséquences peuvent être encore plus dramatiques dans les zones en développement telles que l'Afrique, à cause du manque d'accès aux soins et à d'autres services sociaux. Les inondations fréquentes, par exemple, peuvent entraîner des maladies liées à l'eau ou d'autres infections indirectes comme la dengue ou la malaria qui se propagent par les moustiques proliférant dans les zones humides. Les sécheresses peuvent également avoir des effets dévastateurs tels que les famines.
En améliorant les prévisions sur les incidences du changement climatique en Afrique, il sera possible de prendre des mesures pour en réduire les effets nuisibles, comme par exemple planifier la mise en œuvre d'infrastructures d'irrigation ou promouvoir des récoltes résistantes à la sécheresse. Le projet « AfricanClimate@Home » bénéficiera de l'énorme puissance informatique de la grille World Community Grid. Composé de centaines de milliers d'ordinateurs personnels dans le monde, le World Community Grid bénéficie d'une puissance de calcul qui le place parmi les 5 plus importants supercalculateurs de la planète. Les chercheurs bénéficieront de cette puissance pour perfectionner les modèles de prévisions climatiques. Ils travailleront sur des simulations dans des petites régions d'Afrique, pour ensuite les recouper avec des observations réelles.
Si les modèles de climat à grande échelle permettent d'obtenir une vision de l'évolution climatique sur de larges zones, ils ne reflètent pas nécessairement ce qui pourrait arriver dans une région donnée. En effet, les modèles globaux ne prennent pas suffisamment en compte les grands lacs, les montagnes ou les plaines qui peuvent avoir une incidence sur le climat local.
“Travailler sur les prévisions climatiques nécessite une puissance de calcul phénoménale à cause de toutes les variables possibles, comme la température, le vent, la pression et l'humidité. Pour améliorer les modèles de climat, nous avons besoin d'algorithmes plus poussés qui correspondront davantage à ce qui est observé dans les zones locales. Grâce au World Community Grid, nous bénéficierons de la puissance de calcul nécessaire pour conduire les tests qui nous permettront d'optimiser nos modèles”, précise le Docteur Mark Tadross, directeur de recherche.
Une fois que les chercheurs disposeront des modèles permettant de prévoir de façon plus précise les schémas climatiques, ils pourront travailler à des estimations sur les conséquences du changement climatique sur une région donnée.
Ces études sont essentielles dans une zone du monde en développement qui souvent ne dispose pas d'une infrastructure appropriée. Obtenir des prévisions sur tout changement climatique important, notamment lié à des événements extrêmes comme les sécheresses ou les inondations, peut permettre aux communautés vulnérables ou aux équipes de gestion de catastrophes d'agir en amont.
« Nous pouvons tous contribuer à cette recherche simplement en faisant don de la puissance inutilisée de notre ordinateur », explique Stan Litow, IBM Vice President of Corporate Citizenship and Corporate Affairs. « Si vous utilisez un ordinateur et si vous avez un accès à Internet, vous pouvez participer à un projet informatique humanitaire dans une zone du monde où l'accès aux ordinateurs et les connections haut débit ne sont pas aussi développés ».
Source : http://www.ibm.com/news/fr/fr/2007/09/cp2105.html
Pour plus d'informations : (Articles en Anglais)
In Depth Research Description
Status Report
Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue
Afin de stopper la propagation de maladies infectieuses mortelles menaçant maintenant d'atteindre des proportions épidémiques autour du globe, WCG a lancé un effort de recherche sans précédent en collaboration avec la branche médicale de l'Université du Texas (UTMB) et l'Université de Chicago pour découvrir des médicaments pour traiter et guérir la fièvre hémorragique de la dengue, l'encéphalite du Nil occidental, l'hépatite C et une foule de maladies apparentées, notamment la fièvre jaune.
La dengue, présente dans toutes les régions tropicales et subtropicales du monde, et l'encéphalite du Nil occidental, qui affecte l'Afrique, l'Asie, l'Europe, et plus récemment, les États-Unis, n'ont aucun traitement médicamenteux connu. Ces maladies sont principalement transmises aux adultes et aux enfants par les moustiques infectés, et sont responsables des millions de malades, ainsi que de milliers de décès tous les ans. Sans traitement disponible, ces infections affectent sévèrement les ressources médicales déjà sous pression dans les pays développés et en voie de développement.
Le projet, « Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue » emploiera la vaste puissance informatique de WCG pour trouver les médicaments qui arrêteront la réplication des virus qui causent ces maladies. Une fois les composés identifiés par l'analyse informatique approfondie, les chercheurs peuvent commencer à tester ces médicaments en laboratoires et cliniques pour déterminer leur efficacité.
« L'encéphalite du Nil occidental et d'autres maladies dans cette famille, y compris l'hépatite et autres encéphalites, continuent d'être de profondes préoccupations de santé publique aux États-Unis, puisqu'aucun médicament n'est connu pour les traiter » précise le Dr. Ayo Oduola, du programme spécial pour la recherche et la formation sur les maladies tropicales (SPRTTD - Special Programme for Research and Training in Tropical Diseases) à l'Organisation Mondiale de la Santé et membre du comité consultatif de WCG. « La poursuite de la recherche est nécessaire de sorte que les scientifiques puissent mieux comprendre ces virus et alors développer les traitements qui pourraient sauver beaucoup de vies. »
Les chercheurs estiment qu'environ 50.000 années de calcul informatique sont nécessaires pour découvrir des antiviraux efficaces. Sur WCG, ce projet pourrait être accompli en moins d'un an. Et plus de puissance de calcul sera offerte, plus la recherche sera conduite rapidement.
Le Dr. Stan Watowich, chercheur et professeur agrégé de biochimie à l'UTMB, explique, « sans WCG, nous serions dans une impasse, nous devrions écarter toutes les hypothèses qui se sont avérées être des obstacles aux précédents efforts de développement de médicaments. WCG nous permet d'exécuter des calculs complets qui donnent des résultats biochimiques précis, et nous donne donc les meilleures chances de découvrir des traitements pour ces maladies mondialement préoccupantes. »
La première phase du projet ciblera une des protéines primaires qui permet aux virus de se répliquer, et confrontera cette protéine à une base de données de plus de six millions de molécules médicamenteuses qui pourraient empêcher la réplique du virus. La deuxième phase, qui est plus complexe, prédira quelles molécules médicamenteuses sont les plus intimement liées aux protéines virales, et ainsi lesquelles ont les meilleures possibilités d'inhiber la réplique des virus. À partir de ces calculs, les chercheurs testeront alors les quelques douzaines de molécules sélectionnées dans les laboratoires et les cliniques, ce qui est la phase suivante du développement de traitements pour la commercialisation.
« N'importe qui avec un ordinateur et un accès d'Internet peut être une partie de la solution pour aborder ce souci crucial de santé, » s'enthousiasme Stanley Litow, Vice Président de la Corporate Citizenship and Corporate Affairs et Président de la IBM International Foundation. « Simplement en offrant la puissance de calcul inutilisée de nos ordinateurs, nous pouvons tous avoir une profonde influence sur la rapidité qu'aura cette équipe de chercheurs à passer à la prochaine phase de la découverte d'un médicament. Par exemple, si 100.000 volontaires s'inscrivent dans la première semaine pour ce projet, cela pourrait réduire le temps requis pour accomplir les calculs de 50%. »
Pour plus d'informations : (Articles en Anglais)
In Depth Research Description
Status Report
Migration vers BOINC
WCG est heureux d'annoncer qu'il a pris la décision de migrer entièrement vers BOINC.
Cette plateforme de calcul est déjà utilisée depuis novembre 2005 par WCG. A l'origine, elle avait été utilisée pour fournir des applications compatibles pour les utilisateurs de systèmes d'exploitation Linux et Macintosh, mais en raison de sa popularité, WCG supporte également une version BOINC sur Windows depuis décembre 2005. Aujourd'hui, approximativement 50% du temps d'exécution est effectué par des ordinateurs utilisant BOINC, et 80% des nouveaux ordinateurs qui s'enregistrent le font sur le logiciel BOINC.
L'agent BOINC fournit un certain nombre d'avantages par rapport à l'agent UD. Parmi lesquels, le support du calcul multi-processeurs, ainsi que la gestion de la mémoire et de la bande passante. Un examen détaillé de l'agent de BOINC peut être lu ici.
En raison de cette décision, WCG ne programmera plus aucun nouveau projet pour l'agent UD. Deux projets sont actuellement disponibles aux utilisateurs de l'agent UD : FightAids@Home et Human Proteome Folding - Phase 2. Ces deux projets continueront à fonctionner sur l'agent d'UD jusqu'à ce qu'ils soient arrêtés à l'horizon du deuxième trimestre 2008. Il y a actuellement quatre projets disponibles pour les utilisateurs de BOINC : FightAids@Home, Human Proteome Folding - Phase 2, Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue, et AfricanClimate@Home.
Les utilisateurs de l'agent d'UD devront migrer vers BOINC avant l'extinction en visitant le site Web et en téléchargeant puis installant BOINC. Le programme d'installation du logiciel BOINC détectera si un ordinateur fait fonctionner l'agent UD et si il le trouve, il aidera l'utilisateur à le désinstaller. Des détails sur le téléchargement et l'installation de BOINC pour Windows peuvent être trouvés sur notre site. Plus de détails au sujet de la migration sont disponibles sur le forum des membres.
Article traduit du bulletin d'information d'Octobre du site du projet World Community Grid
Site du projet : http://www.worldcommunitygrid.org/