Connexion S'enregistrer

Nouvelles en VO

MOD_LNPD_MORE_CAT Nouvelles en VO  

Détails
Catégorie parente: Actualités

NEWSLETTER Numéro 3 - octobre 2023

SENSIBILISATION DES LYCÉES

Le World Community Grid est une plateforme publique de calcul à haute de calcul à haute performance permettant une recherche et des données ouvertes qui profitent à l'humanité. Alors que nos partenaires scientifiques, financiers, nos partenaires contributeurs et nos bénévoles nous permettent de répondre à certaines des questions les plus urgentes au monde en réduisant le temps de calcul nécessaire, nos partenariats avec les écoles secondaires et les universités nous permettent de préparer la prochaine génération pour l'avenir de la découverte scientifique. World Community Grid a la capacité d'enrichir l'éducation des étudiants et de leur donner les moyens de contribuer à la recherche avancée.

Cette année, nous prévoyons d'étendre notre programme de sensibilisation et de développer plusieurs nouveaux partenariats avec des écoles secondaires. Cette opportunité est ouverte à tous les lycées, mais nous sommes particulièrement enthousiastes à l'idée d'étendre les partenariats aux lycées des communautés isolées où l'accès aux établissements d'enseignement susceptibles de favoriser l'apprentissage des élèves en matière de calcul de haute performance et de vastes domaines de recherche peut être limité. Si vous êtes un enseignant ou un élève intéressé, ou si vous connaissez quelqu'un qui pourrait l'être, veuillez nous contacter directement.

Nos partenariats actuels avec des écoles secondaires comprennent la Sisler High School Cyber Academy à Winnipeg (Manitoba) au Canada, et la Boca Raton Community High School à Palm Beach County, Floride, États-Unis. Le WCG a été intégré de manière transparente dans dans leurs salles de classe et leurs activités extrascolaires afin d'enrichir l'apprentissage des élèves. Par exemple, la Sisler Cyber Academy a d'abord intégré le WCG dans son programme avec un devoir permettant aux élèves d'exécuter le WCG sur plusieurs ordinateurs. En 2019, un étudiant passionné de la Sisler Cyber Academy et son professeur, M. Esposito, ont visité l'institut de recherche Krembil à Toronto en Ontario, au Canada, devenant ainsi les premiers volontaires du WCG à rencontrer l'équipe du Dr Jurisica sur place. L'intérêt des élèves pour les WCG s'est accru, l'intérêt des étudiants pour les WCG a conduit à la création d'un club WCG qui enseigne aux étudiants comment comment mettre en place des grappes de calcul à haute performance, participe au WCG et soutient les découvertes scientifiques, suscite des conversations sur les questions de sécurité et d'environnement., de découvertes scientifiques, suscite des conversations sur les nouveaux développements de recherche et organise des concours de calcul en grille. Pour en savoir plus sur la Sisler Cyber Academy, lisez notre article sur la sensibilisation dans cette école.

Au lycée communautaire de Boca Raton, les élèves ont également créé un club WCG et l'intérêt pour ce club a été tel que plus de 130 élèves se sont inscrits pour en savoir plus sur WCG lors de leur "Club Rush" cette année. WCG a également été intégrés dans leur programme de sciences par le biais de présentations sur les projets de recherche soutenus par les projets des WCG. Vous pouvez en savoir plus sur les activités de sensibilisation de cette école secondaire dans notre article sur le club des WCG de Boca Raton.

Au-delà de ces exemples de partenariats entre les WCG et les lycées, nous explorons de nouvelles options de sensibilisation pour l'année à venir.
Par exemple, nous avons commencé à explorer la possibilité de travailler avec les coopératives des lycées et d'établir un lien avec leurs programmes de bénévolat, car toutes les écoles secondaires de l'Ontario exigent une expérience de bénévolat. Nous offrons également aux élèves la possibilité de développer leurs compétences en matière de rédaction scientifique. Les étudiants auront notamment la possibilité de définir des termes scientifiques pour un public général et de créer du contenu sur les projets de recherche du WCG pour nos comptes de médias sociaux, sous le mentorat d'étudiants universitaires. Nous sommes ravis de ces possibilités d'étendre notre portée et d'enrichir l'apprentissage de la prochaine génération. Et comme nous planifions la phase d'expansion du WCG, tout nouveau bénévole et partenaire augmente la capacité à soutenir davantage de projets.

(la suite ci-dessous)

Affichages : 1301

Lire la suite : WCG NEWSLETTER Numéro 3 octobre 2023

Détails
Catégorie parente: Actualités

WCG : L'équipe MCM a effectué des recherches sur le GSDMB

Nous poursuivons notre travail de caractérisation des biomarqueurs du cancer du poumon identifiés dans le cadre du projet MCM1. Cette mise à jour se concentre sur GSDMB, un gène associé à la survie du cancer du poumon et exprimé de manière différentielle dans plusieurs types de cancer par rapport aux tissus normaux.

Projet : Cartographie des marqueurs du cancer

Publié le : 12 juil. 2023

Contexte

Reconnaître des schémas chez les patients atteints de cancer peut présenter de nombreux avantages, notamment permettre de détecter des signes de cancer chez d'autres patients et personnaliser le traitement de chaque patient en fonction de son profil cancéreux spécifique. Depuis novembre 2013, les volontaires de la World Community Grid ont donné plus de 820 800 années CPU au projet, aidant à analyser les données de recherche sur les cancers et les sarcomes à une vitesse que l'on n'aurait jamais cru possible auparavant. Nous sommes immensément reconnaissants envers les volontaires qui continuent à faire des dons à ce projet et qui nous aident à accélérer la recherche de meilleurs biomarqueurs.

Nous poursuivons notre analyse des biomarqueurs les plus courants chez les patients atteints de cancer du poumon. Après les discussions sur les gènes VAMP1 et FARP1 décrites dans nos mises à jour de mars et d'avril, nous nous concentrons ici sur le GSDMB.

Affichages : 990

Lire la suite : WCG : 'équipe MCM a effectué des recherches sur le GSDMB

Détails
Catégorie parente: Actualités

Soumis le 20 Apr 2023 15:22:16 UTC

Les résultats de notre recherche tout ciel d'ondes gravitationnelles continues dans les données publiques du troisième cycle d'observation de LIGO (O3) ont été publiés sur le serveur de prépublication arXiv : Deep Einstein@Home all-sky search for continuous gravitational waves in LIGO O3 public data. Le manuscrit est actuellement en cours d'évaluation par les pairs pour publication dans The Astrophysical Journal.

Notre publication décrit l'étude Einstein@Home de l'ensemble du ciel à la recherche d'ondes gravitationnelles continues à des fréquences comprises entre 20 Hz et 800 Hz, en utilisant les dernières données LIGO. À ce jour, il s'agit de la recherche la plus sensible dans cette gamme.

La recherche n'a révélé aucun signal d'ondes gravitationnelles. Sur cette base, nous tirons des conclusions sur la population d'étoiles à neutrons dans notre voisinage galactique. Par exemple, dans un rayon de 100 parsecs (~330 années-lumière) autour de la Terre, il n'y a pas d'étoiles à neutrons tournant à plus de 12 000 tours par minute avec des montagnes équatoriales de plus d'un demi-millimètre ; sinon, nous aurions très probablement détecté leurs ondes gravitationnelles continues.

L'équipe LIGO ajoute de faux signaux continus d'ondes gravitationnelles aux données, à des fins de validation. Les paramètres du signal sont connus. Dans son domaine de recherche, notre recherche récupère avec précision les faux signaux. Cela nous conforte dans la sensibilité de notre recherche.

Actuellement, nous effectuons des recherches supplémentaires sur les données publiques de LIGO. Alors que nous continuons à explorer ces données à la recherche d'ondes continues, nous remercions du fond du cœur tous ceux d'entre vous qui rendent ce travail possible en donnant des cycles à partir de leurs ordinateurs !

Si vous souhaitez en savoir plus, répondez à cette nouvelle dans notre forum de discussion.

M. Alessandra Papa

https://www.aei.mpg.de/continuouswaves

Source : https://einsteinathome.org/fr/content/results-deep-all-sky-search-ligo-o3-data

Affichages : 1353

Détails
Catégorie parente: Actualités

 

Les recherches de l'équipe MCM sur les biomarqueurs du cancer du poumon ont permis d'identifier 26 gènes présents avec les meilleurs scores dans toutes les tailles de signatures considérées. Cette mise à jour se concentre sur VAMP1, un gène lié à la survie des patients et exprimé différemment dans le poumon normal par rapport au cancer du poumon.

Projet : Mapping Cancer Markers

Publié le : 20 mars 2023

Terminologie

  • Signature génétique : Un ensemble de gènes dont il est démontré qu'ils jouent un rôle spécifique dans une maladie est appelé signature génétique. Lorsqu'une telle signature peut prédire la présence d'une maladie, on parle de signature génétique diagnostique. Lorsque la signature est liée à la survie, on parle de signature pronostique.
  • Coefficient de corrélation de Matthews : Méthode statistique utilisée pour évaluer la performance d'un modèle prédictif. Il mesure les différences entre les valeurs réelles et les valeurs prédites.
  • Sondes : Courtes séquences d'ADN ciblant une petite région d'un transcrit (gène). Pour les rendre plus spécifiques, les sondes sont organisées en ensembles de sondes, qui sont utilisés pour détecter et quantifier la présence de séquences génétiques par hybridation en raison de la complémentarité entre la sonde et la cible.

Contexte

Le projet Mapping Cancer Markers vise à identifier les marqueurs associés à différents types de cancer à l'aide d'un algorithme de recherche heuristique. Le projet analyse des millions de points de données collectés à partir d'ensembles de tissus de patients et identifie des modèles permettant de détecter le cancer plus tôt, d'identifier les patients à haut risque et d'adapter le traitement à chaque patient. Initialement axé sur le cancer du poumon, le projet s'est étendu à l'étude du cancer de l'ovaire et, plus récemment, à l'analyse du sarcome.

En novembre 2021, les volontaires du WCG auront donné plus de 800 millions d'unités de travail pour la recherche sur plusieurs types de cancer, dont 193, 379 et 245 millions d'unités de travail pour les cancers du poumon, de l'ovaire et du sarcome, respectivement. À ce jour, plus de 810 000 années de recherche informatique ont été données à MCM, et près de 240 années sont générées chaque jour. Nous vous remercions de nous aider à comprendre les signatures du cancer.

Figure 1 : Nombre d'unités de travail achevées par type de cancer et taille de la signature.

Figure 1 : Nombre d'unités de travail achevées par type de cancer et taille de la signature.

Affichages : 1417

Lire la suite : Le point sur les recherches de l'équipe MCM (mars 2023)

Détails
Catégorie parente: Actualités

Le projet SCC est entré dans la phase suivante de la recherche et de nouvelles unités de travail ont été préparées pour le redémarrage de BOINC.

Le projet : Smash Childhood Cancer

Publié le : 22 mars 2023

Contexte

Alors que les protéines et autres molécules qui jouent un rôle clé dans les cancers de l'enfant ont été identifiées, trouver des composés chimiques (médicaments) candidats qui peuvent cibler ces molécules et modifier leur fonction est un processus de longue haleine. Grâce à la puissance de calcul du WCG, l'équipe Smash Childhood Cancer a pu rechercher des millions de médicaments candidats en vue d'une éventuelle application clinique.

Le projet a fonctionné par intermittence, identifiant les candidats médicaments possibles et les testant ensuite en laboratoire. En décembre 2020, 48 000 heures de calcul avaient été données à l'équipe SCC par les bénévoles du WCG. Depuis lors, l'équipe a été occupée à valider les résultats qu'elle a reçus (voir les mises à jour récentes).

Mise à jour de mars 2023

Nous sommes ravis de partager une mise à jour de l'équipe Smash Childhood Cancer concernant le début de la nouvelle phase de leur quête pour guérir le cancer. La nouvelle protéine cible est MyoD1 (protéine de différenciation myogénique 1) et l'une de ses mutations, L122R. MyoD1 est un facteur de transcription qui active les gènes spécifiques des muscles et qui intervient dans le passage de la croissance à la différenciation des cellules. La perte de contrôle de cette commutation peut entraîner la formation de rhabdomyosarcomes.

L122R est une mutation fréquemment trouvée dans les rhabdomyosarcomes, et elle est liée à un pronostic plus défavorable2. Compte tenu de la structure cristalline déposée dans la Protein Data Bank, l'objectif est de trouver des composés qui agissent sur le type mutant mais pas sur le type sauvage.

 

Structure cristalline du complexe domaine bHLH-ADN de MyoD : perspectives sur la reconnaissance de l'ADN et implications pour l'activation transcriptionnelle

De nouvelles unités de travail du SCC ont été préparées pour faciliter la recherche, et les volontaires qui suivent ce projet pourront les télécharger une fois que nous aurons redémarré BOINC après la panne de stockage.

Si vous avez des commentaires ou des questions, veuillez les laisser dans ce fil de discussion pour que nous puissions y répondre. Merci pour votre soutien, votre patience et votre compréhension.

L'équipe WCG

Source : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=783

Traduction : merci à DeepL.com quand même, pratiquemente rien à corriger.

Affichages : 1324

Détails
Catégorie parente: Actualités

Une brève mise à jour de l'équipe ARP, comprenant des détails sur les changements apportés à leur système de stockage.

Projet : Africa Rainfall Project

Contexte

Le projet Africa Rainfall vise à effectuer des simulations informatiques de tempêtes de pluie en Afrique subsaharienne afin d'améliorer les prévisions météorologiques pour la région. Il est essentiel pour l'agriculture et l'autosuffisance de fournir des données météorologiques précises à la communauté agricole locale. En comparant les résultats obtenus par le calcul des données pluviométriques provenant de diverses sources à l'aide du World Community Grid, les scientifiques peuvent créer des prévisions de plus en plus précises et améliorer les simulations futures et, par conséquent, les prévisions météorologiques. Pour en savoir plus sur les détails spécifiques du projet, consultez notre mise à jour de l'ARP de mars 2022.

Depuis décembre 2022, l'équipe ARP a interrompu la publication de nouvelles unités de travail, jusqu'à ce qu'elle ait résolu les limites de capacité de son système de stockage. Pour en savoir plus sur cette pause, consultez notre mise à jour du forum sur l'état des unités de travail.

Les 100 derniers jours de l'African Rainfall Project

Nous avons interrogé l'équipe de l'ARP sur les derniers développements et voici ce qu'elle a partagé avec nous :

"L'African Rainfall Project a connu une période très calme, du moins sur le plan opérationnel. En coulisses, les changements nécessaires ont été apportés pour que le projet puisse redémarrer. Dans les articles précédents, nous avons beaucoup parlé des volumes de données impliqués, qui sont en effet impressionnants. Il s'agit toutefois d'un problème majeur en termes de stockage et de déplacement de ces données d'un endroit à l'autre. Dans le cas de l'ARP, les résultats des volontaires sont envoyés par le WCG aux ordinateurs de SURF, l'organisation collaborative pour les technologies de l'information dans l'éducation et la recherche aux Pays-Bas. Les premiers 200TB ont pu être stockés sur disque, ce qui est relativement facile d'accès. Il s'agit toutefois de la quantité maximale autorisée. Il existe également un "stockage de travail", où les résultats peuvent être analysés et comparés. Officiellement, la quantité maximale autorisée est de 50 To, mais l'ARP avait envoyé 150 To, de sorte que les données devaient être déplacées ailleurs. Dans ce cas, "ailleurs" était le stockage sur bande, qui reste en fait le moyen le moins cher de stocker des données, mais qui implique également de déplacer physiquement des bobines de bande vers et depuis les unités de lecture et d'écriture. Même si ces bandes sont déplacées par un robot, on peut imaginer que cela prend un certain temps et que l'on ne déplace des données sur ou hors de la bande qu'une fois de temps en temps. On pourrait probablement donner l'ordre de copier simplement chaque lecteur de fichiers sur la bande, mais cela resterait probablement bloqué quelque part et il pourrait y avoir des erreurs de transcription. Au lieu de cela, nous avons déplacé les données une génération à la fois (c'est-à-dire deux jours de simulation) et nous avons utilisé une fonction de hachage pour nous assurer que les bits sur le support d'origine étaient les mêmes que sur le nouveau support.

Ce problème a été résolu et les volontaires du projet sur les précipitations en Afrique peuvent donc poursuivre leurs activités. Nous disposons maintenant d'environ 265 jours de résultats et nous aimerions vraiment compléter l'année complète avec les 100 derniers jours en raison du caractère très saisonnier des précipitations en Afrique. Près de l'équateur, il y a généralement deux saisons des pluies et deux saisons sèches, car la zone de convergence intertropicale se déplace avec le soleil. Au nord et au sud, il y a généralement une saison des pluies et une saison sèche relativement longue. Une année complète ajoute donc une réelle valeur scientifique au jeu de données. Le soutien de SURF pour le stockage à grande échelle prendra fin, mais une solution différente à long terme a été trouvée pour s'assurer que les scientifiques puissent continuer à analyser les résultats afin de mieux comprendre les conditions météorologiques en Afrique et leur prévisibilité".

Fortes pluies en Afrique. Photo : Jan Friesen

Merci à l'équipe de l'ARP pour son partenariat continu avec les WCG et pour son aide dans la création de cette mise à jour. Si vous avez des commentaires ou des questions, veuillez les laisser dans ce fil de discussion pour que nous puissions y répondre. Nous vous remercions de votre soutien.

L'équipe du WCG

Publié le : 15 mars 2023

Source : https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=781

Affichages : 1259
  1. Des nouvelles de Einstein@Home sur les recherches de pulsars radio et gamma
  2. World Community Grid - February 2023 OpenZika Project Update
  3. 18e anniversaire de WCG
  4. Mise à jour de la recherche de l'équipe du Smash Childhood Cancer (octobre 2022)
  5. Entretien avec l'équipe du projet Africa Rainfall
  6. Le point sur la recherche par l'équipe du CCN

Page 2 sur 35