Article sur Rosetta paru dans le Seattle Times ( voir l'article original en anglais )
Mardi , 30 mai 2006
Les chercheurs en bio-médecine de l'université de Washington font appel aux ordinateurs inviduels pour faire avancer leurs recherches
The Associated Press
Related |
PREV
Le chercheur en bio-médecine David Baker voudrait vous faire comprendre que la clé d'un vaccin contre le Sida ou d'une thérapie contre le cancer pourrait très bien se trouver sous une couche de poussière dans votre cagibi, sur votre bureau, etc... . Tout celà sans rien faire ou alors juste en faisant fonctionner un écran de veille.
Votre ancien ordinateur ou votre ordinateur en idle pourrait être celui dont Baker a besoin pour transformer ses idées en une véritable percée scientifique.
Baker, 43 ans, un chercheur de l'Université de Washington, dû se rendre à l'évidence, il y a 2 ans. Il ne possédait ni la puissance de calcul nécessaire pour découvrir des structures de protéine au niveau atomique ni l'argent pour acheter du temps de calcul sur des super-calculateurs.
Mais au même moment où il réalisait les limites de son projet, des chercheurs à l'université de Berkeley en Californie décidèrent de partager le logiciel qu'ils avaient développé pour armer la puissance de calcul maison (Seti ). Celui-ci ayant pour but la recherche d'une vie intelligente dans l'univers, il était alors le plus grand projet de calcul partagé avec près de 953.000 ordinateurs.
L'université de Californie fut la pionnière de l'infomatique répartie , mais l'idée a aussi été adoptée par d'autres, y compris Google, qui met à disposition dans sa toolbar un lien appelé Google Compute offrant la possibilité de donner la puissance de calcul inutilisé par son processeur.
Le projet Rosetta@home de Baker attire les utilisateurs d'ordinateur qui trouvent que d'aider à la recherche d'un traitement pour le cancer est intéressante et ils admirent sa façon de faire participer à sa recherche les personnes comme vous et moi .
« Des communautés virtuelles de volontaires se forment et font des choses merveilleuses, » Ajoute Baker . Les « gens aiment se réunir pour de nobles causes. »
Presque 60.000 personnes offrent la puissance de leur ordinateur à la recherche de Baker - ce qui équivaut à la puissance d'un super-calculateur. Il espère multiplier ce nombre par 10 - ce qui serait assez pour aboutir à des percées scientifiques majeures.
Les participants au projet viennent du monde entier, mais le premier donateur de temps machine est venu de l'autre côté du campus de l'université de Washington, plus précisement de l'Housing and Food Services.
« J'avais une idée précise de l'énorme puissance que mes PC pourraient apporter si on les rassemblait tous, » ajoute Ethan Owens, 27, un employé du département qui avait donné le temps de ses ordinateusr à la recherche de vie extraterrestre.
Owens a approché le département d'astronomie, qui n'a pas eu besoin des 200 ordinateurs de son département, ainsi il a proposé son offre à Baker.
Les premières conversations entre Baker et Owens se sont produites peu de temps après que l'université de Californie ait commencé à offrir l'accès à son logiciel à n'importe quel personne qui le désirait. Bientôt, les serveurs des dortoirs, les ordinateurs du laboratoire, les bureaux d'entretien et le centre d'affaire du restaurant sont devenus une composante du laboratoire de Baker.
Mais lorsque les cours ont repris l'automne dernier, les deux organismes travaillaient ensemble pour recruter des étudiants afin de mettre le logiciel de gestion de réseau sur leurs PC et depuis le projet s'est développé aussi bien à l'intérieur qu'à l'extérieur du campus.
L'Aide des survivants
Parmis les volontaires les plus actifs, on trouve des survivants du cancer ou des personnes qui ont perdu des amis, des membres de leur famille à cause de cette maladie.
Philip Williams, 53 ans , qui programme des logiciels pour le gouvernement fédéral de Washington D.C. , a indiqué qu'il a commencé à sortir de vieux Macs hors de son débarras, lorsqu'il en a appris plus au sujet du projet Rosetta. Ce deux fois survivant de la maladie de Hodgkin a un petit réseau sans fil à la maison et projette dès que possible d'ajouter plus d'ordinateurs.
Bien que Williams continue à mettre à dispostion le temps de ses machines à d' autres projets, sa fidélité se tourne clairement vers le projet du professeur Baker.
Le « groupe de recherche de Baker amène les personnes à penser qu'elles font partie prenante du projet, » ajoute William , qui a également offert de son temps pour aider à résoudre les problèmes que d'autres participants avaient avec le logiciel.
Baker ajoute que ce n'est pas juste les utilisateurs qui pensent qu'ils sont importants pour le projet - Sincèrement, ils le sont vraiment.
« En tant que scientifique, une des choses que vous êtes censé faire est de partager ses connaissances avec la majorité. Le partage cmmunautaire est devenu fondamental pour résoudre les problèmes, », Baker précise en outre que son équipe a eu de bonnes idées au sujet de nouveaux angles de recherches, en faisant par exemple participer le public aux résultats des recherches autant que possible. Certaines de ces idées sont mise en application sur le Message Board du projet.
De quel manière les volontaires aident la recherche
Les volontaires recrutent de nombreuses personnes, font des suggestions relatives au logiciel et aident à la mise au point de nouvelles versions du logiciel avant qu'il ne soit envoyé à chacun sur Rosetta@home.
William ajoute que la participation de Baker au message board du projet et la communication directe du scientifique avec les scientifiques amateurs qui offrent leur temps machine ont fait de Rosetta beaucoup plus que ce qu'il aurait pu devenirsans celà, c'est à dire le petit projet bizarre du mois.
« Ce n'est pas un travail insignifiant que ce type fait, » poursuit William « Puisqu'il n'explore pas simplement le côté biomédical de son travail , mais aussi la façon d'utiliser son ordinateur, et surtout il offre l' occasion à des personnes qui n'ont pas de connaissances médicales de contribuer vraiment. »
David P. Anderson, directeur de projet du logiciel open source de Berkeley qui a rendu Rosetta@home possible, a indiqué que le laboratoire de Baker a fait un travail particulièrement bénéfique pour relier les participants à la science, y compris partager l'impact médical potentiel des essais.
« Rosetta fixe une norme que les autres projets devront suivre s'ils veulent obtenir plus de participants, » conclut Anderson .
© 2006 copyright Seattle Times Company
Informations
Le projet Rosetta@home :